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一、基本原理
Western Blot 即蛋白免疫印跡,是等量上樣的蛋白樣品通過(guò)電泳按分子量分離蛋白質(zhì)、再轉(zhuǎn)移到合適的膜上,然后通過(guò)特異性抗體對(duì)膜上的目的蛋白或特定位點(diǎn)修飾進(jìn)行結(jié)合和識(shí)別,經(jīng)過(guò)抗體偶聯(lián)的顯色或顯影系統(tǒng)獲得條帶結(jié)果,通過(guò)分析條帶位置和深度來(lái)分析目的蛋白或特定位點(diǎn)修飾的水平。
二、步驟
(一)由蛋白樣品制備;制膠、上樣、電泳;轉(zhuǎn)膜;封閉、抗體孵育;曝光五個(gè)步驟組成,其簡(jiǎn)要流程如下:
詳細(xì)實(shí)驗(yàn)步驟:
1.蛋白樣品制備
1.1蛋白樣品制備選擇合適的裂解液
根據(jù)蛋白性質(zhì)不同,選擇裂解液也不同,常用產(chǎn)品名稱(chēng):①RIPA裂解液②NP-40裂解液③SDS裂解液
區(qū)別:
1.2蛋白濃度測(cè)定(BCA法)
①配制蛋白標(biāo)準(zhǔn)品
取0.8mL蛋白標(biāo)準(zhǔn)配制液加入到一管(20mgBSA)蛋白標(biāo)準(zhǔn)管中,充分溶解后,配置成25 mg/mL的蛋白標(biāo)準(zhǔn)溶液。配制成的蛋白標(biāo)準(zhǔn)溶液可-20℃長(zhǎng)期保存。
取適量25 mg/mL蛋白標(biāo)準(zhǔn)溶液,用PBS或去離子水稀釋至終濃度為0.5 mg/mL的蛋白標(biāo)準(zhǔn)工作液。
②繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(酶標(biāo)儀法)
將標(biāo)準(zhǔn)品按0、1、2、4、8、12、16、20μL加入到96孔板中,加稀釋液補(bǔ)足到20μL 。加適當(dāng)體積樣品到96孔板孔中,如果樣本不足20μL,需加稀釋液補(bǔ)足到20μL。注意記錄樣品體積。
③配制BCA顯色液
根據(jù)樣品數(shù)量, 配制BCA 工作液,按50體積 BCA 試劑 A 加入1體積 BCA 試劑 B (50:1)配置適量 BCA 工作液,充分混勻。BCA 工作液室溫24h內(nèi)穩(wěn)定。每個(gè)待測(cè)樣品需200 μL,建議按需配制,避免浪費(fèi)。
④酶標(biāo)儀檢測(cè)
向標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品孔及待測(cè)樣品孔中每孔加入BCA顯色液200 μL,37℃放置20-30min。用酶標(biāo)儀測(cè)定A562或540-595nm之間的其他波長(zhǎng)吸光度。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線和使用的樣品體積計(jì)算出樣品的蛋白濃度。
⑤計(jì)算
根據(jù)繪出的標(biāo)準(zhǔn)曲線及所測(cè)樣品的吸光值,計(jì)算出樣品實(shí)際蛋白濃度。
1.3蛋白變性
按照體積,加入Loading Buffer 并混勻,95℃加熱變性10min,置于-20℃冰箱儲(chǔ)存。
1.4本實(shí)驗(yàn)室貼壁細(xì)胞提蛋白步驟(蛋白提取試劑盒:invent Total Protein Extraction Kit for Animal Cultured Cells and Tissues SD-001/SD-002)此步驟僅供參考,具體以自己所用試劑說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。
①樣品間數(shù)量保持相對(duì)一致的T25細(xì)胞培養(yǎng)瓶,加入SD-001,500μl,冰上充分裂解10min,刮取細(xì)胞裂解液。
②移入預(yù)冷的柱子中,12000rmp,離心30S。
③棄去柱子,將蛋白置于冰上。
④進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定,BCA法,詳細(xì)步驟見(jiàn)上文(本實(shí)驗(yàn)室所用試劑盒:碧云天BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒。具體以自己所用試劑說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。)
⑤按照提取蛋白的體積,加入適量Loading Buffer 混勻,開(kāi)水煮10min,置于-20℃冰箱儲(chǔ)存。
2. 制膠、上樣、電泳
2.1制膠
2.1.1濃縮膠、分離膠濃度的選擇
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),凝膠由兩種不同的凝膠層組成,上層為濃縮膠,下層為分離膠。濃縮膠為大孔膠,緩沖液pH6.7,膠濃度通常為5%;分離膠為小孔膠,緩沖液pH8.9,分離膠濃度需要根據(jù)蛋白分子量大小,選擇不同濃度的分離膠用于實(shí)驗(yàn)。
2.1.2本實(shí)驗(yàn)室制膠步驟(以Servicebio 10%PAGE彩色凝膠超快速配置試劑盒為例)此步驟僅供參考,具體以自己所用試劑說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。
①把玻璃板洗凈晾干→對(duì)齊玻璃板(短板在前,長(zhǎng)板在后)→放入制膠架子中,兩側(cè)夾子卡緊,下端與桌面垂直→將制膠架子放在塑料架上固定好。
②加滿超純水,檢測(cè)是否漏液(靜置幾分鐘后檢查,無(wú)漏液,倒掉,倒置晾干或用無(wú)屑紙吸干)。
③配制體系
a.取兩只50ml離心管,分別將下層膠A、B液按說(shuō)明書(shū)比例倒入混勻,上層膠A、B液倒入混勻
b.先配下層膠:加入同比例的促凝劑(10%AP),混勻,用巴氏管或移液槍沿玻璃加入,加到綠帶下線即可,注意要?jiǎng)蛩?,不要產(chǎn)生氣泡。
c.加無(wú)水乙醇液封,加滿(動(dòng)作輕柔,不要產(chǎn)生氣泡),等待下層膠凝固(20-30min/離心管中剩余的是否凝/也可通過(guò)觀察,會(huì)有折線出來(lái)提醒已經(jīng)凝固)。
d.倒掉上層無(wú)水乙醇(倒置晾干或用無(wú)屑紙吸干)。
e.配制上層膠:加入同比例的促凝劑(10%AP),混勻,將剩余空間加滿(上層膠比較容易凝,加的時(shí)候要快速一點(diǎn),但是不要有氣泡),將梳子插入上層膠中(加完上層膠后立即插入,注意傾斜角度插入避免氣泡產(chǎn)生)。
f.待上層膠凝固。
④配液:
running buffer:一包粉劑配1L超純水,用于跑膠,還可用于配好的膠板的保存。
Transfer buffer:一包粉劑配800ml超純水+200ml甲醇,用于轉(zhuǎn)膜,配好后4度預(yù)冷。
TBST:一包粉劑+2L超純水+2ml洗滌劑Tween-20,用于洗滌。
2.2上樣:
①根據(jù)分組和定量結(jié)果上樣,上樣前先加熱煮沸,然后離心
②雙手緩慢垂直拔出梳子,并將RunningBuffer倒入內(nèi)外槽中,形成閉合回路。內(nèi)槽 Running Buffer需注滿,外槽RunningBuffer沒(méi)過(guò)最低刻度線即可。
③用移液器吸取樣品,垂直上樣,將槍頭置于兩塊玻璃板之間上樣泳道的位置,輕輕插入其中(不能用力插入,擠壓玻璃板),緩慢打出樣本,待樣本全部打出時(shí),停頓2秒再拔出槍頭,保證樣品全部加入上樣泳道。
④記得上marker
2.3電泳:
①上樣完以后,連通電泳儀電源,注意正負(fù)極連接正確(黑對(duì)黑,紅對(duì)紅)
②設(shè)定適宜的電泳參數(shù)(以10%為例,濃縮膠電泳參數(shù)為恒壓60V,30min;待樣本進(jìn)入分離膠時(shí),可將電泳調(diào)至120V,60min)。
③當(dāng)溴酚藍(lán)到凝膠底部時(shí),停止電泳,關(guān)閉電泳儀電源。
3.轉(zhuǎn)膜
SDS-PAGE凝膠中的蛋白因結(jié)合SDS而帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)的作用下,帶負(fù)電的蛋白會(huì)轉(zhuǎn)移到膜上。
3.1膜類(lèi)型的選擇
3.2轉(zhuǎn)膜條件的選擇
3.3本實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)膜步驟。此步驟僅供參考,具體以實(shí)際為準(zhǔn)。
3.3.1準(zhǔn)備工作
a.轉(zhuǎn)膜液至少提前2h(即開(kāi)始電泳后)放入﹣20℃冰箱預(yù)冷。
b.目的蛋白>20KD選擇0.45μ m NC 膜;目的蛋白<20KD選擇0.2μ m 的 NC 膜或0.22μ m 的 PVDF 膜,選擇完畢后將 NC 膜放在 Transfer Buffer 中浸泡備用,如使用的是 PVDF 膜需先放入甲醇中浸泡2-3min,再放入Transfer Buffer 中浸泡備用。
3.3.2轉(zhuǎn)膜
取出玻板中的凝膠,在夾板上依次放一塊黑色海綿墊、兩張濾紙、凝膠、NC 膜、兩張濾紙、一塊黑色海綿墊("三明治"結(jié)構(gòu)),將轉(zhuǎn)好的膜放在轉(zhuǎn)膜槽,再放進(jìn)電泳儀中的時(shí)候黑板對(duì)黑面,白板對(duì)紅面,其中電泳儀內(nèi)放一塊冰盒,將電泳儀置到冰盆內(nèi),倒?jié)MTransfer buffer,調(diào)到恒A 300mA轉(zhuǎn)膜1h:
3.4麗春紅染色(可選)
帶負(fù)電荷的麗春紅染料能夠與膜上帶正電的氨基酸發(fā)生可逆結(jié)合,以判斷轉(zhuǎn)膜效率。
轉(zhuǎn)膜后將膜用麗春紅染色,染色后將膜裁剪,保留目的條帶,用TBS 洗三遍(每次5min.80r),以去除染色,再進(jìn)行后續(xù)膜封閉及抗體孵育。
4.封閉、抗體孵育
4.1封閉
蛋白轉(zhuǎn)膜后,膜上尚有未結(jié)合蛋白的部位,可以采用封閉液進(jìn)行封閉,以減少非特異性結(jié)合。
4.1.1封閉液選擇
①脫脂奶粉:通常封閉液的濃度為 2.5-5% (w/v)。經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,封閉效果較強(qiáng);缺點(diǎn):目標(biāo)蛋白是磷蛋白的話會(huì)有很多背景信號(hào)。即使目標(biāo)蛋白不是磷蛋白,因?yàn)槭堑鞍踪|(zhì)的混合物,也容易產(chǎn)生較高的背景信號(hào)。
②牛血清白蛋白(BSA):是從牛血清中提純之后的一種球蛋白,通常含有BSA的封閉液的濃度為2-5%(w/v)。缺點(diǎn):價(jià)格高,提純過(guò)程中有可能含有IgG或其他血清蛋白等污染物,這些蛋白都可以和哺乳動(dòng)物抗體產(chǎn)生交叉反應(yīng),會(huì)增加非特異性背景信號(hào)。
③商品化封閉液:通常含有提純過(guò)的蛋白,里面不含有磷蛋白、免疫球蛋白、白蛋白、生物素 等其他封閉液中難以避免的成分。每個(gè)商品化封閉液都有自己的Protocol,封閉時(shí)間很快。
4.1.2本實(shí)驗(yàn)室封閉步驟
將膜取出,放入合適的孵育槽中,快速封閉液( NCM Bioth NcmBlot Blocking Buffer 快速封閉液)封閉30-60min,用TBST洗三遍(每次5min.80r)
4.2抗體孵育
一抗識(shí)別膜上蛋白或修飾性抗原表位,二抗識(shí)別一抗恒定區(qū)從而與一抗結(jié)合,最終通過(guò)二抗攜帶的熒光或酶顯色信號(hào),達(dá)到對(duì)樣本中目的蛋白進(jìn)行檢測(cè)的目的。一抗孵育推薦4℃過(guò)夜,可以提高抗體結(jié)合效率,并有助于降低背景;二抗一般為室溫孵育。
4.2.1內(nèi)參選擇
胞漿和全細(xì)胞蛋白:GAPDH(37 KD),β-actin(43 KD),Tubulin(55 KD)
胞核蛋白:PCNA(29 KD),Histone H3(17 KD)
核膜蛋白:lamin B(66 KD)
線粒體蛋白:COX IV(17 KD),VDAC1(30 KD)
4.2.2單克隆抗體和多克隆抗體選擇
抗體分單克隆抗體(monoclonal antibody, MAb)和多克隆抗體(polyclonal antibody, pAb)。
單克隆抗體是只能與特定的、單一抗原結(jié)合的抗體,而多克隆抗體是能與一種以上抗原結(jié)合的抗體。單克隆抗體特異性明顯強(qiáng)于多克隆抗體。在WB實(shí)驗(yàn)中使用單克隆抗體檢測(cè)目的蛋白,多呈單一的、清晰條帶,實(shí)驗(yàn)結(jié)果良好;而使用多克隆抗體可能導(dǎo)致多條帶或條帶不清晰,實(shí)驗(yàn)結(jié)果質(zhì)量欠佳。
4.2.3抗體種屬選擇
①目標(biāo)蛋白的種屬:首先確定要檢測(cè)的目標(biāo)蛋白所屬的物種。如果樣品來(lái)自人類(lèi),那么選擇來(lái)自其他物種的抗體,如小鼠、兔子或羊等,因?yàn)檫@些抗體通常對(duì)人類(lèi)蛋白有較高的特異性。
②一抗種屬:選擇與樣品來(lái)源不同種屬的一級(jí)抗體。例如,如果樣品來(lái)自人類(lèi),那么可以選擇小鼠或兔子的抗體作為一抗。這種不同種屬的抗體可以識(shí)別并結(jié)合到目標(biāo)蛋白上。
③二抗種屬:選擇與一抗相應(yīng)種屬的二抗。二抗是與一抗結(jié)合的抗體,其可被用于探測(cè)和檢測(cè)一抗。通常情況下,二抗是標(biāo)記有較容易檢測(cè)的熒光染料或酶的抗體。
④物種交叉反應(yīng):在選擇抗體時(shí)要注意潛在的物種交叉反應(yīng)。一些抗體可能對(duì)多個(gè)物種的蛋白具有較高的交叉反應(yīng)性,這可能會(huì)導(dǎo)致誤解或干擾。確保驗(yàn)證抗體的特異性,并查閱相關(guān)文獻(xiàn)以了解抗體在特定物種中的應(yīng)用情況。
⑤每個(gè)實(shí)驗(yàn)都是獨(dú)特的,對(duì)于不同的目標(biāo)蛋白和實(shí)驗(yàn)條件,可能需要進(jìn)行不同的選擇和優(yōu)化。因此,在選擇抗體種屬時(shí),請(qǐng)參考相關(guān)文獻(xiàn)、抗體供應(yīng)商的指南,并根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行驗(yàn)證和優(yōu)化。
4.2.4一抗孵育
按抗體說(shuō)明書(shū)比例,分別將一抗和actin抗體用一抗稀釋液配好,分別將膜浸泡到配好的抗體中,覆蓋搖勻(40r,1h)4°冰箱敷過(guò)夜;過(guò)夜后將抗體回收,膜用TBST洗三遍(每次5min,80r)
4.2.5二抗孵育
二抗抗體按抗體說(shuō)明書(shū)比例用二抗稀釋液配好,將洗好的膜置入盒內(nèi),用二抗覆蓋搖勻(40r1h),后將抗體回收,膜用TBST洗三遍(每次5min.80r)
5.曝光
5.1原理
WB 檢測(cè)中,二抗偶聯(lián)的最常見(jiàn)的酶是 HRP (辣根過(guò)氧化物酶),以 ECL 為底物進(jìn)行發(fā)光檢測(cè)。
5.2本實(shí)驗(yàn)室發(fā)光步驟
以ECL Western Blot kit超靈敏化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒 (西安壯志科技有限公司) 及化學(xué)發(fā)光凝膠成像系統(tǒng) Tanon-5200Multi為例。此步驟僅供參考,具體以自己買(mǎi)的試劑說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。
①根據(jù)膜的大小,按照1:1將A液、B液混勻,配制成發(fā)光檢測(cè)工作液。
②將膜取出,去除膜上多余的液體,放在塑料盒中,用移液器將工作液加到膜上,來(lái)回吹吸5-8次,使其均有覆蓋。
③化學(xué)發(fā)光凝膠成像系統(tǒng):將膜放置到成像儀內(nèi),參考儀器說(shuō)明書(shū)進(jìn)行檢測(cè),顯影觀察結(jié)果。
三、常見(jiàn)問(wèn)題及解決方法
(一)條帶弱或無(wú)目的條帶
(二)多條帶或非特異性條帶
(三)條帶位置異常(表觀分子量與理論不符)
(四)高背景
(五)條帶變形