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什么是PCR,病毒是如何被檢測(cè)出來的?

瀏覽:1184 發(fā)表時(shí)間:2024-07-30

聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴(kuò)增技術(shù)。它能在一個(gè)試管內(nèi)將所要研究的目的基因或某一DNA片段于數(shù)小時(shí)內(nèi)擴(kuò)增至十萬乃至百萬倍,使肉眼能直接觀察和判斷;可從一根毛發(fā)、一滴血、甚至一個(gè)細(xì)胞中擴(kuò)增出足量的DNA供分析研究和檢測(cè)鑒定。PCR技術(shù)是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的一項(xiàng)革命性創(chuàng)舉和里程碑。PCR實(shí)驗(yàn)室其實(shí)功能極其強(qiáng)大,定性分析和定量檢測(cè)是它最大的兩個(gè)應(yīng)用方向,那除了新冠核酸檢測(cè),我們“萬能”的PCR實(shí)驗(yàn)室還能做些什么呢?接下來就給大家展示幾個(gè)具體應(yīng)用方向的項(xiàng)目示例,也希望通過這些示例可以給各級(jí)醫(yī)療系統(tǒng)提供一些項(xiàng)目開展的思路和方向。


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病原體測(cè)定

PCR技術(shù)的問世使病原體檢測(cè)能夠方便地進(jìn)行,具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、操作簡(jiǎn)便、省時(shí)等特點(diǎn),它不僅可用于基因分離克隆和核酸序列分析等基礎(chǔ)研究,還可用于疾病的診斷和任何有DNA和RNA的地方。由于PCR技術(shù)假陽性率太高,只要有微量病原體存在就可得到陽性結(jié)果,這并不能作為診斷依據(jù),只有當(dāng)一定數(shù)量的病原體存在時(shí)才有臨床意義。因此,對(duì)模板準(zhǔn)確定量顯得特別重要,應(yīng)用熒光技術(shù)PCR就能夠快速、準(zhǔn)確地得到結(jié)果。對(duì)于解決免疫學(xué)檢測(cè)的“窗口期”問題,判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態(tài),以及抗體檢測(cè)不能判定是現(xiàn)癥感染還是既往感染時(shí),均可利用PCR進(jìn)行確定。用于體外定性檢測(cè)新型冠狀病毒感染的肺炎疑似病例、疑似聚集性病例患者、其他需要進(jìn)行新型冠狀病毒感染診斷或鑒別。


遺傳病檢測(cè)

基因突變和拷貝數(shù)變異是遺傳病發(fā)生的主要遺傳學(xué)基礎(chǔ),也是遺傳病檢測(cè)的主要靶標(biāo)。遺傳病的復(fù)雜性伴隨著基因突變數(shù)目多、類型廣;基因拷貝數(shù)變異不僅表現(xiàn)為缺失和復(fù)制,而且缺失位置、大小以及復(fù)制倍數(shù)都呈現(xiàn)多樣性。遺傳變異的復(fù)雜性為遺傳病的臨床檢測(cè)提出了技術(shù)挑戰(zhàn)。實(shí)時(shí)PCR技術(shù)是我們最近發(fā)展起來新一代實(shí)時(shí)PCR技術(shù),利用熒光標(biāo)記或熔點(diǎn)分析,可以在單個(gè)反應(yīng)管內(nèi)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo)。


腫瘤研究

腫瘤是危害人類健康的一種疾病,它的惡性程度與預(yù)后判斷主要依靠是否有轉(zhuǎn)移和病理切片分期。隨著分子生物學(xué)的迅猛發(fā)展,腫瘤研究領(lǐng)域的大量研究成果顯示,腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、治療和預(yù)后與腫瘤細(xì)胞內(nèi)部基因和腫瘤相關(guān)病毒有關(guān)。很多原癌基因和抑癌基因的表達(dá)情況的檢測(cè)都可揭示了癌變的可能性,而PCR方法學(xué)可以解決此類問題,此外,PCR方法用于體外定性檢測(cè)人外周血血漿中septin9基因甲基化,用于各種腫瘤的臨床輔助診斷。


病毒是如何被檢測(cè)出來的?

病毒性疾病的臨床診斷主要是利用建立在抗原和抗體特異性反應(yīng)基礎(chǔ)上的免疫學(xué)方法,這些方法或者是以已知抗原來檢測(cè)抗體,或者是以已知抗體來檢測(cè)抗原,免疫學(xué)方法所進(jìn)行的病毒診斷準(zhǔn)確、靈敏、快速、簡(jiǎn)便、成本低。PCR是一種在體外高效擴(kuò)增特異性DNA的方法。其原理是用一對(duì)與雙鏈DNA互補(bǔ)的人工合成寡核苷酸作引物,使靶DNA在試管內(nèi)特異地反復(fù)復(fù)制,直到能夠用標(biāo)準(zhǔn)的核酸雜交方法檢測(cè)出來。此復(fù)制過程可導(dǎo)致靶DNA上百萬倍擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物的由兩個(gè)引物與DNA模板結(jié)合部位之間的距離決定。其方法是靶DNA首先在90~95℃加熱變性,冷卻至37~50℃退火,使引物與靶DNA的特異序列互補(bǔ)配對(duì),在67~70℃由大腸桿菌Taq聚合酶進(jìn)行每一條鏈的復(fù)制。新合成的DNA鏈含引物的互補(bǔ)序列,可作為下一輪聚合反應(yīng)的模板。如此變性、退火、聚合,在溫度91、50、67℃調(diào)節(jié)下反復(fù)進(jìn)行,使靶DNA大量擴(kuò)增,擴(kuò)增的DNA拷貝數(shù)(Y)、放大效率(X)和循環(huán)次數(shù)(n)有以下關(guān)系:Y=(1+X)n。由于多聚酶鏈反應(yīng)能夠直接高效擴(kuò)增核酸,所以即使只要有極微量的病毒核酸存在,經(jīng)擴(kuò)增后都可以方便地檢出,對(duì)其進(jìn)行克隆和序列測(cè)定,或以其它方法進(jìn)行分析。通過選擇特異性的寡核苷酸引物,也可以確定病毒的類型。原則上,只要有一個(gè)病毒基因存在,就可以利用這一技術(shù)檢測(cè)出來,故大大提高了病毒檢測(cè)方法的靈敏性。第一例人免疫缺陷病毒2型(HIV-2)就是用這種方法發(fā)現(xiàn)的。(2023-8-17-22)


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