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- 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- 動(dòng)物飼養(yǎng) 疾病造模 行為學(xué)檢測(cè) 心功能 無創(chuàng)血壓 血常規(guī) 全自動(dòng)生化檢測(cè)等
- 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- CCK8/MTT 原代細(xì)胞分離 流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞劃痕 侵襲 遷移 EDU染色 轉(zhuǎn)染 穩(wěn)定株篩選
樣本制備注意事項(xiàng)
1、根據(jù)不同的檢測(cè)細(xì)胞調(diào)整合適的溫度、濕度、酸堿度等培養(yǎng)環(huán)境,注意一定要無菌的環(huán)境培養(yǎng)。
2、培養(yǎng)細(xì)胞時(shí),以對(duì)數(shù)期處理為宜,避免細(xì)胞量過少導(dǎo)致收集細(xì)胞量不足或者細(xì)胞量過多導(dǎo)致細(xì)胞開始大量死亡造成的實(shí)驗(yàn)誤差。
3、流式檢測(cè)細(xì)胞周期上機(jī)檢測(cè)所需收集細(xì)胞量較多,收集細(xì)胞時(shí)盡量多收集一些
4、流式檢測(cè)對(duì)細(xì)胞離心,重懸次數(shù)較多,注意動(dòng)作輕緩,避免過多地?fù)p傷、弄破細(xì)胞。
5、本實(shí)驗(yàn)對(duì)細(xì)胞離心,重懸次數(shù)較多,注意動(dòng)作輕緩,避免過多地?fù)p傷細(xì)胞。
6、細(xì)胞周期待測(cè)細(xì)胞盡量要獲得單個(gè)細(xì)胞,避免DNA的降解。
7、樣本最關(guān)鍵的就是減少碎片(EDTA/不可過度吹打/離心rpm)。PI既能與DNA結(jié)合,又能與RNA結(jié)合,所以要用RNase降解。PI質(zhì)量及RNase所加量很重要,建議用商品化試劑。
8、污染脫氧核糖核酸酶會(huì)降解DNA,故玻璃器皿和試劑要干凈滅菌。
9、染液等物質(zhì)有一定毒性,注意防護(hù)。
流式檢測(cè)時(shí)的注意事項(xiàng)
01
固定時(shí)必須預(yù)冷PBS重懸打入無水乙醇中,做到隨加隨混勻,避免細(xì)胞形成團(tuán)塊。
02
固定后細(xì)胞雖然可以保存較長(zhǎng)時(shí)間后再上機(jī)檢測(cè),為避免不可控因素影響最好盡早上機(jī)檢測(cè)。
03
進(jìn)樣速度:一般檢測(cè)細(xì)胞濃度調(diào)整為2*10^5到2*10^6/ml,建議進(jìn)樣速度為低速。若峰形較寬、CV較大,可能就是進(jìn)樣速度太快。
04
儀器質(zhì)控定期做,檢查質(zhì)控微球的CV值,盡可能排除因機(jī)器設(shè)置引起的峰形加寬。
05
通過電壓脈沖信號(hào)的寬度、高度、面積等參數(shù)區(qū)別實(shí)體組織標(biāo)本中的粘連細(xì)胞群體,最大程度的減少粘連細(xì)胞帶來的假陽性結(jié)果。
06
選擇合適的細(xì)胞系,不同的細(xì)胞系由于細(xì)胞形態(tài)、直徑等不同,會(huì)對(duì)結(jié)果的美觀程度有一定的影響,筆者常用HeLa細(xì)胞系,峰形較細(xì),周期各階段明顯區(qū)別,結(jié)果美觀。
07
建議選擇6孔板操作,細(xì)胞給藥密度在40%左右,給藥時(shí)間不一定要與蛋白印跡法給藥時(shí)間一致。這是由于蛋白印跡法檢測(cè)的是蛋白表達(dá)的變化,例如給藥10小時(shí),蛋白上可見明顯變化趨勢(shì),但10小時(shí)收樣時(shí),孔內(nèi)細(xì)胞已經(jīng)明顯觀察到細(xì)胞漂浮凋亡,那對(duì)流式檢測(cè)的結(jié)果會(huì)有很大的影響。流式細(xì)胞術(shù)收樣時(shí),盡量保證孔內(nèi)細(xì)胞還未漂浮。
08
收樣時(shí),如果孔內(nèi)已經(jīng)有細(xì)胞漂浮,細(xì)胞上清懸浮液也要收集。建議選用胰酶消化,消化時(shí)間必須嚴(yán)格控制,及時(shí)終止消化,消化時(shí)間太久,容易對(duì)細(xì)胞造成損傷和死亡。
09
收集細(xì)胞時(shí),離心機(jī)選用4℃,300-500g離心5分鐘,小心吸去上清。加入0.3 mL預(yù)冷的PBS,將管內(nèi)的細(xì)胞混勻后,再加入0.7 mL預(yù)冷的無水乙醇,4℃固定過夜。整個(gè)收樣過程中,不要用槍頭劇烈吹打細(xì)胞,一是會(huì)損傷細(xì)胞,二是造成細(xì)胞損失。
10
上機(jī)前,離心機(jī)選用4℃,300-500g離心5分鐘,棄去上清。此時(shí)格外需要注意的是由于不同時(shí)期細(xì)胞的重量不一樣,離心后細(xì)胞不是全部沉淀在管底,管壁上也會(huì)存在大量細(xì)胞,去上清一定要注意。加入100 μg/mL的PI染色液,避光染色15分鐘以上,上機(jī)測(cè)試前最好使用200目篩網(wǎng)過篩,以免細(xì)胞聚集堵塞機(jī)器管道。
細(xì)胞周期檢測(cè)常見問題解答與處理
問
細(xì)胞量太少,得不到數(shù)據(jù)結(jié)果白做了咋辦?
答
待測(cè)的細(xì)胞已經(jīng)制備完了太少不容易挽救,正確的操作方法如下:
1)要保證收集足夠的細(xì)胞樣品(個(gè)人經(jīng)驗(yàn)至少收集100萬左右);如果藥物處理后細(xì)胞死亡過多,應(yīng)該降低藥物濃度;
2)固定細(xì)胞時(shí)先用預(yù)冷的PBS 重懸細(xì)胞,再逐滴滴入無水乙醇中;
3)細(xì)胞清洗時(shí),不可過度吹打細(xì)胞,以防產(chǎn)生過多的細(xì)胞碎片;
4)最后,盡量采用尖底的離心管和水平的離心機(jī),離心后盡量用移液槍吸走上清,不要傾倒,殘留一點(diǎn),不要吸完。
問
可不可以用70~75%乙醇直接固定細(xì)胞,反正乙醇固定細(xì)胞的終濃度也是這么多?
答
不可以,直接用70~75%乙醇加入很容易導(dǎo)致細(xì)胞聚團(tuán)現(xiàn)象,很難重懸成單細(xì)胞,影響固定效果,甚至容易導(dǎo)致固定后無細(xì)胞沉淀的現(xiàn)象。
正確做法是:待細(xì)胞充分分散成單細(xì)胞后,緩慢地滴入無水乙醇中,使其終濃度為70~75%乙
醇。
問
在測(cè)定細(xì)胞周期的時(shí)候,由于固定、消化等處理后會(huì)出現(xiàn)很多細(xì)胞碎片,影響測(cè)量結(jié)果,無法找到G1期細(xì)胞群怎么辦?
答
在測(cè)定細(xì)胞周期的時(shí)候,除了設(shè)苦好獲取數(shù)據(jù)的模版外,另外設(shè)置直方圖,測(cè)量模式為線性放大,調(diào)整放大倍數(shù),使二倍體峰出現(xiàn)在橫坐標(biāo)50道的位置,就很容易的找到了二倍體峰和細(xì)胞周期個(gè)時(shí)相細(xì)胞的分布情況。
問
做流式分析細(xì)胞周期時(shí),收集了10^6左右的細(xì)胞,但是固定后沒有細(xì)胞沉淀,甚至 PBS 洗滌后上機(jī)已經(jīng)沒有細(xì)胞了,哪個(gè)環(huán)節(jié)出了問題?
答
確定收集了足量細(xì)胞但是沒有細(xì)胞沉淀且上機(jī)沒看見待測(cè)細(xì)胞的話,應(yīng)該洗滌過程中細(xì)胞丟失了。
1)盡量采用尖底的離心管和水平離心機(jī)
2)離心后盡量用吸管吸取上清,不要傾倒,吸上清時(shí)最好殘留1mm左右的水膜,不要吸完。
3)離心的轉(zhuǎn)速或時(shí)間可以適當(dāng)增加。
4)每次加試劑時(shí),吸頭最好不要接觸液面,混勻時(shí)最好不要用吸頭吹打,以免吸頭掛壁帶走部分細(xì)胞。
問
什么樣的數(shù)據(jù)可以用?
答
1)G2/M期細(xì)胞的DNA 含量是G1期的2倍,在直方圖上形成一個(gè)2倍于G1信號(hào)峰的高斯峰。
2) CV(變異系數(shù))表示峰的寬度,CV值越小,峰形越好,最好是在5%左右,一般小于10%也被認(rèn)可。
3) RCS 最好是在1~3,高于5則不被認(rèn)可。RCS高,說明數(shù)據(jù)的分布和軟件所建立模型的預(yù)期值的差別比較大,可能由于處理細(xì)胞的時(shí)候RNA 酶消化不好,或者是PI的濃度不佳造成的。
問
怎樣提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分辨率和精確度?
答
變異系數(shù)(Coefficient of Variation,CV值)反映G0/G1峰分辨率和精確度。而樣品 CV值為樣品固有,與樣本制備過程中細(xì)胞質(zhì)量有關(guān)。細(xì)胞碎片越少、細(xì)胞聚團(tuán)越少、RNA酶消化越充分,可以減少樣本的CV值,提高 G0/G1峰分辨率和精確度。
主營(yíng)項(xiàng)目
1
動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物飼養(yǎng)、疾病造模、行為學(xué)檢測(cè)、心功能、無創(chuàng)血壓、血常規(guī)、全自動(dòng)生化檢測(cè)等
2
細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
CCK8/MTT、原代細(xì)胞分離、流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞劃痕、侵襲、遷移、EDU染色、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定株
3
分子生物學(xué)
PCR檢測(cè)、熒光定量PCR、絕對(duì)定量PCR、端粒酶長(zhǎng)度、pull down、雙熒光素酶、SSR、SNP檢測(cè)等
4
蛋白實(shí)驗(yàn)
WB、Co-IP、酵母雙雜
5
病理實(shí)驗(yàn)
HE染色、免疫組學(xué)、電鏡
6
生理生化實(shí)驗(yàn)
肝腎功能、抗氧化、免疫反應(yīng)等生理免疫指標(biāo);動(dòng)植物營(yíng)養(yǎng)指標(biāo)、微量元素、重金屬、酶活等。
7
多組學(xué)實(shí)驗(yàn)
基因組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白組、代謝組、微生物多樣性、宏基因組、生信分析
8
整體課題實(shí)驗(yàn)
方案設(shè)計(jì)、整體實(shí)驗(yàn)交付、標(biāo)書寫作、論文潤(rùn)色、協(xié)助投稿
END
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